De 5e montessori heeft, zoals geregeld in de Wet Medezeggenschap op scholen (2007) een medezeggenschapsraad (MR). De MR bestaat uit 4 personeelsleden en 4 ouders. De personeelsleden van MR worden gekozen door het team en de ouderleden door middel van een algemene verkiezing.
De MR heeft als taak en wettelijk recht de belangen van leerlingen, personeelsleden en ouders zo goed mogelijk te behartigen. De MR buigt zich over onderwerpen op financieel, organisatorisch en beleidsmatig vlak. Onderwerpen die aan de orde komen tijdens de MR-vergadering zijn bijvoorbeeld: onderwijstijd, ouderbijdrage, schoolgids en jaarplan.